Opel Zafira prvej generácie zaznamenal veľký úspech, veď takmer za 7 rokov produkcie sa v nemeckej Bochumi vyrobilo a na mnohých európskych aj zámorských trhoch predalo zhruba 1,5 milióna vozidiel. Zafira sa predávala aj na japonskom trhu pod obchodným menom Subaru Traviq. Druhá generácia modelu mala teda na čo nadväzovať. Okrem novej techniky výrobca výrazne zapracoval aj na zlepšení kvality svojich vozidiel. Jedným dychom však treba dodať, že konkurencie pribúdalo a aj preto už neboli predaje Zafiry tak dynamické ako v prípade prvej generácie. Nič to ale nemení na fakte, že aj druhá generácia si získala mnoho fanúšikov a v obľube je aj ako jazdenka, kde je záujem predovšetkým o dieselové modely.

Zafira druhej generácie (alebo teda Zafira B) sa predstavila svetu na Ženevskom autosalóne v roku 2005. Do predaja prišla v polovici roka a hneď od začiatku dostala širokú paletu motorov. Benzínový základ tvorí 1,6 16V (77 kW), ďalej štvorvalec 1.8 16V s premenlivým časovaním sacích ventilov (103 kW), potom 2,2 16V s priamym vstrekom benzínu (110 kW) a vrcholom je 2.0 T (147 kW). Ozajstný vrchol však prišiel až v závere roka 2005, Zafira OPC s výkonnejšou verziou rovnakého motora 2,0 T (176 kW). Vznetové motory sú známe jednotky GM Fiat Powertrain s rovnakým zdvihovým objemom a označením 1.9 CDTI, ale v troch výkonových variantoch 74 kW, 88 kW a 110 kW. Zafira II. generácie je MPV v sedemmiestnom prevedení, kde dve sedadlá v treťom rade sú zasunuté do podlahy kufra. Možno ich však jednoducho vyklopiť a z päťmiestneho vozidla tak jednoducho vytvoriť sedemmiestne. V roku 2006 vznikol zo základnej 1,6 16V (77 kW) motor pre verziu na zemný plyn 1.6 CNG. Pri prevádzke s týmto palivom má však nižší výkon 69 kW.

V roku 2008 prešlo vozidlo faceliftom, ktorý priniesol dynamickejšiu krivky zovňajšku a dva nové motory pod kapotou. Predná časť bola len mierne upravená v štýle modelov OPC, vozidlo dostalo dynamickejšie bočné linky prahov, rozšírené blatníky, ľahko prepracovaná bola tiež zadná časť auta. V interiéri boli zmenené dekory prístrojového panelu a obloženia dverí, pribudlo chrómovania na ovládacích tlačidlách klimatizácie a autorádia. Ďalšou zmenou boli dva motory. Prvým je preplňovaný 1.7 CDTI. Ponúkal sa v dvoch výkonových variantoch, 81 a 92 kW, využíva služby systému priameho vstrekovania nafty do valcov common-rail a používa štvorventilovú techniku ​​so systémom riadeného vírenia zmesi. Motor nahradil najslabšiu verziu 1.9 CDTI o výkone 74 kW. Druhý motor je značne modernizovaný atmosférický benzínový 1.6 ECOTEC, ktorý plní funkciu základnej motorizácie Zafiry. Doplnený bol o dve technické novinky, systém riadeného satia vzduchu pomocou dvoch sacích kanálov TWINPORT a technológiu variabilného časovania ventilov Cam-Phase.

Modernizovaný bol aj samotný systém TWINPORT, ktorý funguje bez škrtiacich klapiek v sacom potrubí a využíva plastové sacie potrubie s dvoma dĺžkami. Konštruktérom sa podarilo optimalizovať geometriu vstupu sacích kanálov v kombinácii s časovaním ventilov, resp. natáčaním vačkových hriadeľov. Takáto možnosť riadenej zmeny plnenia bez nežiaduceho škrtiaceho efektu klapiek znižuje spotrebu paliva. Za označením Cam-Phase sa skrýva plynulé časovanie sacích i výfukových ventilov prostredníctvom natáčania ich vačkových hriadeľov závislosti na aktuálnom jazdnom režime. Oba vačkové hriadele ovláda riadiaca jednotka motora nezávisle prostredníctvom dvoch kompaktných lopatkových hydraulických nastavovacích členov. Tie umožňujú zmenu časovania výfukových aj sacích ventilov a teda aj zmenu odozvy motora, tak, aby jeho charakteristika bola ešte svižnejšia a lepšie vyhovovala požiadavkám vodiča. Vďaka týmto technickým vylepšeniam posilnil agregát na výkon 85 kW a krútiaci moment 155 Nm, čo je o 8 kW, resp. 5 Nm viac ako u jeho predchodcu s rovnakým objemom.

V roku 2009 doplnil motorovú paletu 1,6 CNG Turbo s výkonom 110 kW a krútiacim momentom 210 Nm. Nahradenie vozidla modelom tretej generácie sa odohralo na jeseň 2011, na Frankfurtskom autosalóne.

Bariérový test Euro NCAP absolvovala Zafira druhej generácie v roku 2005. Pochváliť sa môže veľmi dobrým výsledkom, plný počet hviezdičiek za ochranu posádky (33 bodov). Dobre dopadla aj ochrana detí v autosedačkách, ohodnotená  štyrmi hviezdičkami z piatich (37 bodov). Za ohľaduplnosť pri strete s chodcom si Zafira odviezla dve hviezdičky zo štyroch (16 bodov).

Skvelý výsledok dosiahla Zafira aj vďaka karosérii vyrobenej  z vysoko pevných ocelí (51%). Bezpečnostný systém nesie názov SAFETEC a skrýva sa za ním rad bezpečnostných prvkov. Jeho súčasťou je ABS s elektronickým deličom brzdných síl a systémom individuálneho brzdenie kolies v zákrutách CBC, brzdový asistent, elektronický stabilizačný systém ESP Plus, čelné, bočné a priebežné hlavové airbagy pre prvé dve rady sedadiel. Ďalšími prvkami pasívnej bezpečnosti sú aktívne opierky hláv na predných sedadlách, bezpečnostné uchytenie pedálov PRS (Pedal Release System) alebo kotevné body systému ISOFIX pre uchytenie detských sedačiek na oboch krajných miestach v druhom rade sedadiel. Zásadnou novinkou je kompatibilita Zafiry s novým predpisom Európskej komisie, ktorý od októbra 2005 upravuje požiadavky na konštrukciu čela automobilov z hľadiska bezpečnosti chodcov, tak, aby pri eventuálnom konflikte bola miera rizika poranenia potlačená na najnižšiu možnú mieru. Kapota je napríklad vyrobená z plechu hrúbky iba 0.6 mm, ktorý je vystužený ďalším výliskom z plechu s hrúbkou 0,5 mm, v ktorom sú kruhové otvory, čo prispieva k šetrnejšiemu absolvovaniu nárazu.